При избора на напълно автоматична центрофуга трябва да се имат предвид следните фактори:
Скорост на въртене и центробежна сила: Различните проби изискват различни скорости на въртене; изборът трябва да се основава на действителните нужди.
Капацитет: Капацитетът на барабана определя количеството проба, обработено за цикъл; индустриалните приложения обикновено изискват по-голям капацитет.
Материал: Устойчивите-на корозия материали (като неръждаема стомана) са подходящи за обработка на химически реагенти или корозивни проби.
Поддръжка и почистване: Опростеният дизайн улеснява ежедневната поддръжка и почистване.